Agata Słowikowska jest absolwentką PPSM nr 1 im. E. Młynarskiego w klasie skrzypiec prof. Jacka Michałowicza, oraz ZPSM nr 4 im. K. Szymanowskiego, gdzie uczyła się w klasie prof. Pawła Rybkowskiego i prof. Tadeusza Gadziny. W klasie tego pedagoga odbyła również studia w Akademii Muzycznej im. Fryderyka Chopina w Warszawie.
W latach 2010-2014 pracowała w Polskiej Orkiestrze Sinfonia Iuventus. Od października 2014 jest członkiem grupy pierwszych skrzypiec w Teatrze Wielkim – Operze Narodowej w Warszawie. W grudniu 2018 odbyła tourne (Paryż, Wiedeń) w kameralnym zespole z Nigelem Kennedym. Koncertuje również kameralnie jako jeden z solistów niedawno powstałej L’Orchestre du Joli Bord.